Era Provveditore a Treviso, Friuli, Belluno, Feltre, Carnia e Cadore quando nel 1797 Napoleone mosse guerra alla Serenissima Repubblica dopo avere sconfitto l'esercito austriaco nella battaglia di Rivoli; il 2 maggio Bonaparte entrò in Treviso e Giustinian lo accolse con sdegnata fierezza, più di quanta ne avesse mostrata il governo veneziano, incarnando così l'originario spirito di quella Repubblica ormai in decadenza ed anacronistica.